로그를 복붙하지 않고 일부분이 잘린 스샷으로만 올리면 원인 파악이 힘들어집니다.

그래서 이유를 파악할 수 없을 줄 알았는데...

다행히 그나마 메인창 입력 파일 정보의 오디오 쪽에 'truehd'라고 코덱 정보가 있어서 원인을 알 수 있게 됐네요.

오디오 코덱 쪽 문젭니다. 일반적으로 TrueHD 코덱은 mp4 컨테이너 포맷에 담기지 않습니다.

이론상으로는 mp4에 많은 코덱을 담을 수 있지만 먹싱 프로그램과 플레이어들이 잘 지원하지 않습니다.

(참고: 위키피디어 문서 해당 부분)

mkv는 대부분의 코덱이 다 담기고, mp4는 실질적으로 H.264, HEVC, MPEG-4, AV1, AAC(HE-AAC 포함), MP3만 담긴다고 생각하시면 됩니다.

스샷을 보니 비디오 쪽은 HEVC으로 인코딩돼 있는 것 같으니, 비디오는 스트림 복사, 오디오는 AAC나 MP3로 재인코딩하시면 mp4로 변환하실 수 있겠네요.