MP4가 수용할 수 없는 코덱이거나 한 경우일 수 있겠죠.

MKV는 아주 다양한 코덱을 수용할 수 있습니다.

그에 반해 MP4는 한정적이죠. 비디오는 H264, HEVC(H265), AV1.

오디오 코덱은 AAC만 수용할 수 있다고 보는 게 좋을 겁니다.

MP3 같은 것도 수용할 수 있다고는 하지만 MP3인 경우 일부 기기에서 재생이 되지 않는 문제가 있죠.

암튼, MP4가 수용할 수 없는 코덱일 경우엔 스트림 복사가 아닌 일반적인 인코딩 과정을 거쳐

MP4가 수용할 수 있는 코덱으로 바꿔줘야 합니다.

이 문제 외엔 저도 겪어 본 문제가 없어 모르겠네요. 다른 원인이 있는지.

vc1 vp9 이런 비디오코덱들은 mkv만 담고 mp4에 못담습니다